Kebakaran adalah salah satu permasalahan pengelolaan yang dihadapi setiap tahun, oleh sebab itu berbagai upaya dilakukan untuk mengendalikan kebakaran hutan di TN Sebangau. Patroli pencegahan kebakaran/ pengamanan hutan dan patroli pencegahan kebakaran hutan bersama masyarakat di TN Sebangau adalah kegiatan yang rutin dilakukan pada bulan-bulan kemarau untuk menurunkan jumlah hotspot dan mencegah kebakaran hutan. Selain patroli, kesiapsiagaan dan peningkatan koordinasi juga dilakukan dengan kegiatan antara lain : membentuk posko siaga kebakaran hutan, sosialisasi/penyuluhan pengendalian kebakaran hutan. Meskipun telah melakukan berbagai upaya tersebut, jumlah di kawasan TN Sebangau pada tahun 2015 mengalami peningkatan dari tahun sebelumnya, seperti tampak pada gambar dibawah ini:
Pada tahun 2015 Balai TN Sebangau diberikan target maksimal hotspot atau batas toleransi sebanyak 250 titik. Sampai pada akhir tahun yakni 31 Desember 2015 hanya terpantau 126 titik atau tercapai 150%. Jumlah hotspot yang terpantau adalah bulan Juni s.d. Oktober 2015 yang tersebar di 3 SPTN Wilayah dengan perincian 43 titik di SPTN Wilayah I, 24 titik di SPTN Wilayah II dan 59 titik di SPTN Wilayah III.
Capaian fisik kegiatan Patroli pencegahan kebakaran dan pengamanan hutan, patroli pencegahan kebakaran hutan bersama masyarakat, kesiapsiagaan dan peningkatan koordinasi dan sosialisasi/penyuluhan pengendalian kebakaran hutan tercapai 100%. Sedangkan kampanye pencegahan kebakaran hutan berupa pembuatan baliho hanya tercapai satu tema sehingga realisasi fisik hanya mencapai 50%.
Untuk mengoptimalkan penanganan kebakaran hutan, sejak tahun 2014 Balai TN Sebangau telah membangun kantor DAOP di Kasongan dan mulai beroperasi pada tahun 2015. Dalam proses penyelesaian pembangunan kantor DAOP, dilaksanakan kegiatan penunjang lainnya diantaranya yaitu; pembuatan pagar tanah kantor DAOP, pembuatan jembatan masuk dan papan nama kantor DAOP, pembuatan papan SPBK DAOP pengadaan sarana dan prasarana, peralatan perkantoran DAOP. Realisasi fisik penyelesaian pembangunan kantor DAOP Kasongan mencapai 100%. Pemeliharaan sarana prasarana pengendalian karhut dapat terealisasi sebanyak 100%.
